Durante la Guerra Sino-Japonesa, Tsui-Ying huye con su padre de la ocupación japonesa. Conoce a un joven, Ling-Yun, y se enamora. Sin embargo, Tsui-Ying decide dejar a Ling-Yun y se casa con su tío, un traidor que sirve a los japoneses. Desgarrado por el corazón, Ling-Yun abandona el país para estudiar en el extranjero. Mientras tanto, el Agente Especial 001 lidera la resistencia contra los japoneses. Después de que Ling-Yun regresa a Shanghái desde el Reino Unido, se sorprende al descubrir que su ex amante se ha convertido en la esposa de su tío Chao-Chun. El Agente Especial 001 continúa su sabotaje y finalmente se revela la identidad del agente. La primera película de espionaje en taiwanés producida en Taiwán, The Best Secret Agent es un remake de la película de 1945 del mismo nombre que causó sensación en Shanghái.
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