En el año 70 de la era cósmica, la colonia espacial de Junius 7 es devastada por un ataque nuclear, desencadenando así la guerra entre ZAFT, un ejército integrado por los habitantes de las colonias, conocidos como coordinadores, seres humanos mejorados genéticamente, más fuertes e inteligentes, y la alianza terrestre. Un año después, los humanos sin modificaciones genéticas, conocidos como naturales, comienzan a desarrollar Mobile Suits capaces de superar a los Mobile Suits de ZAFT, pero su plan es descubierto. Kira, un joven coordinador que reside en una colonia espacial de la nación neutral de ORB, presencia la invasión y destrucción de su hogar a manos de ZAFT y descubre que su mejor amigo de la infancia, Athrun, se ha convertido en un soldado de ZAFT. Kira decide proteger a sus amigos pilotando el Gundam, pero esto implica una terrible verdad: tendrá que enfrentarse a los coordinadores, entre los que se encuentra su propio amigo Athrun.
Cuando alguien que sigues empiece esta serie, aparecerá aquí con su progreso y reseña.